Protein–RNA interactions for Protein: Q09LZ8

Agbl4, Cytosolic carboxypeptidase 6, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agbl4Q09LZ8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Agbl4Q09LZ8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Agbl4Q09LZ8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Agbl4Q09LZ8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Agbl4Q09LZ8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Agbl4Q09LZ8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Agbl4Q09LZ8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Agbl4Q09LZ8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Agbl4Q09LZ8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Agbl4Q09LZ8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agbl4Q09LZ8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agbl4Q09LZ8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agbl4Q09LZ8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Agbl4Q09LZ8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Agbl4Q09LZ8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Agbl4Q09LZ8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Agbl4Q09LZ8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Agbl4Q09LZ8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Agbl4Q09LZ8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Agbl4Q09LZ8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Agbl4Q09LZ8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Agbl4Q09LZ8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Agbl4Q09LZ8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agbl4Q09LZ8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agbl4Q09LZ8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agbl4Q09LZ8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Agbl4Q09LZ8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Agbl4Q09LZ8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Agbl4Q09LZ8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Agbl4Q09LZ8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Agbl4Q09LZ8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Agbl4Q09LZ8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Agbl4Q09LZ8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Agbl4Q09LZ8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Agbl4Q09LZ8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Agbl4Q09LZ8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Agbl4Q09LZ8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Agbl4Q09LZ8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Agbl4Q09LZ8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Agbl4Q09LZ8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Agbl4Q09LZ8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Agbl4Q09LZ8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Agbl4Q09LZ8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Agbl4Q09LZ8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Agbl4Q09LZ8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Agbl4Q09LZ8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Agbl4Q09LZ8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Agbl4Q09LZ8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Agbl4Q09LZ8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Agbl4Q09LZ8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Agbl4Q09LZ8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Agbl4Q09LZ8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Agbl4Q09LZ8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Agbl4Q09LZ8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Agbl4Q09LZ8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Agbl4Q09LZ8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Agbl4Q09LZ8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Agbl4Q09LZ8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Agbl4Q09LZ8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Agbl4Q09LZ8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Agbl4Q09LZ8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Agbl4Q09LZ8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Agbl4Q09LZ8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Agbl4Q09LZ8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Agbl4Q09LZ8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Agbl4Q09LZ8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Agbl4Q09LZ8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Agbl4Q09LZ8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Agbl4Q09LZ8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Agbl4Q09LZ8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Agbl4Q09LZ8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Agbl4Q09LZ8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Agbl4Q09LZ8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Agbl4Q09LZ8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Agbl4Q09LZ8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Agbl4Q09LZ8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Agbl4Q09LZ8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Agbl4Q09LZ8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Agbl4Q09LZ8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Agbl4Q09LZ8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Agbl4Q09LZ8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Agbl4Q09LZ8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Agbl4Q09LZ8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Agbl4Q09LZ8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Agbl4Q09LZ8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Agbl4Q09LZ8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Agbl4Q09LZ8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Agbl4Q09LZ8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Agbl4Q09LZ8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Agbl4Q09LZ8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Agbl4Q09LZ8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Agbl4Q09LZ8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Agbl4Q09LZ8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Agbl4Q09LZ8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Agbl4Q09LZ8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Agbl4Q09LZ8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Agbl4Q09LZ8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Agbl4Q09LZ8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Agbl4Q09LZ8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Agbl4Q09LZ8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms