Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kcnma1Q08460 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Kcnma1Q08460 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kcnma1Q08460 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kcnma1Q08460 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kcnma1Q08460 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kcnma1Q08460 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kcnma1Q08460 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kcnma1Q08460 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kcnma1Q08460 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kcnma1Q08460 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kcnma1Q08460 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kcnma1Q08460 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kcnma1Q08460 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kcnma1Q08460 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kcnma1Q08460 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Kcnma1Q08460 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kcnma1Q08460 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kcnma1Q08460 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kcnma1Q08460 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kcnma1Q08460 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kcnma1Q08460 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kcnma1Q08460 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kcnma1Q08460 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kcnma1Q08460 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kcnma1Q08460 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kcnma1Q08460 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcnma1Q08460 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcnma1Q08460 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcnma1Q08460 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kcnma1Q08460 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kcnma1Q08460 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kcnma1Q08460 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kcnma1Q08460 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kcnma1Q08460 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kcnma1Q08460 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kcnma1Q08460 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kcnma1Q08460 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kcnma1Q08460 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcnma1Q08460 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcnma1Q08460 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcnma1Q08460 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcnma1Q08460 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcnma1Q08460 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcnma1Q08460 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kcnma1Q08460 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kcnma1Q08460 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kcnma1Q08460 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcnma1Q08460 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcnma1Q08460 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcnma1Q08460 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcnma1Q08460 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcnma1Q08460 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcnma1Q08460 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcnma1Q08460 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcnma1Q08460 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnma1Q08460 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnma1Q08460 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcnma1Q08460 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcnma1Q08460 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcnma1Q08460 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcnma1Q08460 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcnma1Q08460 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kcnma1Q08460 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Kcnma1Q08460 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kcnma1Q08460 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcnma1Q08460 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcnma1Q08460 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcnma1Q08460 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcnma1Q08460 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcnma1Q08460 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kcnma1Q08460 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kcnma1Q08460 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kcnma1Q08460 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnma1Q08460 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnma1Q08460 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnma1Q08460 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnma1Q08460 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnma1Q08460 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnma1Q08460 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnma1Q08460 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnma1Q08460 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kcnma1Q08460 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kcnma1Q08460 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcnma1Q08460 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcnma1Q08460 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcnma1Q08460 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcnma1Q08460 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcnma1Q08460 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcnma1Q08460 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcnma1Q08460 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnma1Q08460 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnma1Q08460 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnma1Q08460 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnma1Q08460 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnma1Q08460 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnma1Q08460 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnma1Q08460 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kcnma1Q08460 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kcnma1Q08460 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms