Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gata4Q08369 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata4Q08369 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata4Q08369 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata4Q08369 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata4Q08369 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gata4Q08369 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gata4Q08369 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gata4Q08369 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gata4Q08369 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gata4Q08369 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gata4Q08369 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gata4Q08369 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata4Q08369 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata4Q08369 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata4Q08369 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gata4Q08369 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gata4Q08369 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gata4Q08369 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gata4Q08369 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gata4Q08369 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata4Q08369 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata4Q08369 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata4Q08369 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gata4Q08369 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gata4Q08369 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gata4Q08369 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gata4Q08369 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gata4Q08369 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms