Protein–RNA interactions for Protein: Q08288

Lyar, Cell growth-regulating nucleolar protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LyarQ08288 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LyarQ08288 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LyarQ08288 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LyarQ08288 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LyarQ08288 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LyarQ08288 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LyarQ08288 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LyarQ08288 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LyarQ08288 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LyarQ08288 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LyarQ08288 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LyarQ08288 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LyarQ08288 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LyarQ08288 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LyarQ08288 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LyarQ08288 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LyarQ08288 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LyarQ08288 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LyarQ08288 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LyarQ08288 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LyarQ08288 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LyarQ08288 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LyarQ08288 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LyarQ08288 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LyarQ08288 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LyarQ08288 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LyarQ08288 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LyarQ08288 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LyarQ08288 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LyarQ08288 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LyarQ08288 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LyarQ08288 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LyarQ08288 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LyarQ08288 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LyarQ08288 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LyarQ08288 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LyarQ08288 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LyarQ08288 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LyarQ08288 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LyarQ08288 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LyarQ08288 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LyarQ08288 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LyarQ08288 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LyarQ08288 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LyarQ08288 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LyarQ08288 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LyarQ08288 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LyarQ08288 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LyarQ08288 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LyarQ08288 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LyarQ08288 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LyarQ08288 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LyarQ08288 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LyarQ08288 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LyarQ08288 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LyarQ08288 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LyarQ08288 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LyarQ08288 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LyarQ08288 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LyarQ08288 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LyarQ08288 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LyarQ08288 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LyarQ08288 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LyarQ08288 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LyarQ08288 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LyarQ08288 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LyarQ08288 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LyarQ08288 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LyarQ08288 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LyarQ08288 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LyarQ08288 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LyarQ08288 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LyarQ08288 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LyarQ08288 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LyarQ08288 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LyarQ08288 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LyarQ08288 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LyarQ08288 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LyarQ08288 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LyarQ08288 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LyarQ08288 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LyarQ08288 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LyarQ08288 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LyarQ08288 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LyarQ08288 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LyarQ08288 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LyarQ08288 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LyarQ08288 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LyarQ08288 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LyarQ08288 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LyarQ08288 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LyarQ08288 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LyarQ08288 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LyarQ08288 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LyarQ08288 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LyarQ08288 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LyarQ08288 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LyarQ08288 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LyarQ08288 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LyarQ08288 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms