Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atf4Q06507 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atf4Q06507 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atf4Q06507 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atf4Q06507 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atf4Q06507 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atf4Q06507 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atf4Q06507 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atf4Q06507 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atf4Q06507 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atf4Q06507 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atf4Q06507 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atf4Q06507 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atf4Q06507 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Atf4Q06507 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atf4Q06507 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atf4Q06507 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atf4Q06507 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atf4Q06507 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atf4Q06507 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atf4Q06507 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atf4Q06507 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf4Q06507 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf4Q06507 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf4Q06507 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf4Q06507 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf4Q06507 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf4Q06507 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf4Q06507 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf4Q06507 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf4Q06507 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf4Q06507 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf4Q06507 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf4Q06507 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf4Q06507 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf4Q06507 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf4Q06507 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf4Q06507 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf4Q06507 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf4Q06507 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf4Q06507 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf4Q06507 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf4Q06507 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf4Q06507 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf4Q06507 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf4Q06507 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atf4Q06507 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf4Q06507 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf4Q06507 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf4Q06507 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf4Q06507 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf4Q06507 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf4Q06507 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf4Q06507 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf4Q06507 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf4Q06507 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf4Q06507 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf4Q06507 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf4Q06507 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atf4Q06507 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atf4Q06507 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atf4Q06507 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atf4Q06507 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atf4Q06507 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf4Q06507 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf4Q06507 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf4Q06507 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf4Q06507 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf4Q06507 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atf4Q06507 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atf4Q06507 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atf4Q06507 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atf4Q06507 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atf4Q06507 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atf4Q06507 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atf4Q06507 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atf4Q06507 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atf4Q06507 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atf4Q06507 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atf4Q06507 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atf4Q06507 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atf4Q06507 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Atf4Q06507 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atf4Q06507 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atf4Q06507 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atf4Q06507 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atf4Q06507 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atf4Q06507 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf4Q06507 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atf4Q06507 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atf4Q06507 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf4Q06507 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf4Q06507 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atf4Q06507 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atf4Q06507 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Atf4Q06507 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf4Q06507 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf4Q06507 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atf4Q06507 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atf4Q06507 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.1 ms