Protein–RNA interactions for Protein: Q05BQ1

Igsf9, Protein turtle homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf9Q05BQ1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Igsf9Q05BQ1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Igsf9Q05BQ1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Igsf9Q05BQ1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Igsf9Q05BQ1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Igsf9Q05BQ1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Igsf9Q05BQ1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Igsf9Q05BQ1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Igsf9Q05BQ1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Igsf9Q05BQ1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Igsf9Q05BQ1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Igsf9Q05BQ1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Igsf9Q05BQ1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Igsf9Q05BQ1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Igsf9Q05BQ1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Igsf9Q05BQ1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Igsf9Q05BQ1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Igsf9Q05BQ1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Igsf9Q05BQ1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Igsf9Q05BQ1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Igsf9Q05BQ1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Igsf9Q05BQ1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Igsf9Q05BQ1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Igsf9Q05BQ1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Igsf9Q05BQ1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Igsf9Q05BQ1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Igsf9Q05BQ1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Igsf9Q05BQ1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Igsf9Q05BQ1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Igsf9Q05BQ1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Igsf9Q05BQ1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Igsf9Q05BQ1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Igsf9Q05BQ1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Igsf9Q05BQ1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Igsf9Q05BQ1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Igsf9Q05BQ1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Igsf9Q05BQ1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Igsf9Q05BQ1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Igsf9Q05BQ1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Igsf9Q05BQ1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Igsf9Q05BQ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Igsf9Q05BQ1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Igsf9Q05BQ1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Igsf9Q05BQ1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Igsf9Q05BQ1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Igsf9Q05BQ1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Igsf9Q05BQ1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Igsf9Q05BQ1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Igsf9Q05BQ1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Igsf9Q05BQ1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Igsf9Q05BQ1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Igsf9Q05BQ1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Igsf9Q05BQ1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Igsf9Q05BQ1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Igsf9Q05BQ1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Igsf9Q05BQ1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Igsf9Q05BQ1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Igsf9Q05BQ1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Igsf9Q05BQ1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Igsf9Q05BQ1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Igsf9Q05BQ1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Igsf9Q05BQ1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Igsf9Q05BQ1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Igsf9Q05BQ1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Igsf9Q05BQ1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Igsf9Q05BQ1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Igsf9Q05BQ1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Igsf9Q05BQ1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Igsf9Q05BQ1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igsf9Q05BQ1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igsf9Q05BQ1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igsf9Q05BQ1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igsf9Q05BQ1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igsf9Q05BQ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igsf9Q05BQ1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igsf9Q05BQ1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igsf9Q05BQ1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Igsf9Q05BQ1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Igsf9Q05BQ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Igsf9Q05BQ1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Igsf9Q05BQ1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Igsf9Q05BQ1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Igsf9Q05BQ1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Igsf9Q05BQ1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Igsf9Q05BQ1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Igsf9Q05BQ1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Igsf9Q05BQ1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Igsf9Q05BQ1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Igsf9Q05BQ1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Igsf9Q05BQ1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Igsf9Q05BQ1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Igsf9Q05BQ1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Igsf9Q05BQ1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Igsf9Q05BQ1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Igsf9Q05BQ1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms