Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox9Q04887 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox9Q04887 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sox9Q04887 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox9Q04887 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox9Q04887 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox9Q04887 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox9Q04887 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox9Q04887 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox9Q04887 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox9Q04887 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sox9Q04887 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox9Q04887 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox9Q04887 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox9Q04887 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox9Q04887 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sox9Q04887 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sox9Q04887 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sox9Q04887 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sox9Q04887 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sox9Q04887 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sox9Q04887 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sox9Q04887 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sox9Q04887 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox9Q04887 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox9Q04887 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox9Q04887 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sox9Q04887 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sox9Q04887 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox9Q04887 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox9Q04887 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox9Q04887 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox9Q04887 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox9Q04887 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox9Q04887 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox9Q04887 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox9Q04887 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox9Q04887 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox9Q04887 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox9Q04887 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox9Q04887 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox9Q04887 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox9Q04887 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox9Q04887 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox9Q04887 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox9Q04887 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox9Q04887 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox9Q04887 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox9Q04887 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox9Q04887 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox9Q04887 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox9Q04887 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox9Q04887 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox9Q04887 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox9Q04887 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox9Q04887 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox9Q04887 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox9Q04887 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox9Q04887 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox9Q04887 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox9Q04887 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox9Q04887 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox9Q04887 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox9Q04887 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox9Q04887 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox9Q04887 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox9Q04887 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms