Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcnb1Q03717 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcnb1Q03717 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcnb1Q03717 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcnb1Q03717 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcnb1Q03717 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcnb1Q03717 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcnb1Q03717 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kcnb1Q03717 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kcnb1Q03717 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kcnb1Q03717 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnb1Q03717 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnb1Q03717 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnb1Q03717 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnb1Q03717 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnb1Q03717 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnb1Q03717 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnb1Q03717 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnb1Q03717 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnb1Q03717 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnb1Q03717 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kcnb1Q03717 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kcnb1Q03717 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kcnb1Q03717 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kcnb1Q03717 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kcnb1Q03717 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kcnb1Q03717 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcnb1Q03717 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnb1Q03717 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnb1Q03717 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnb1Q03717 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnb1Q03717 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnb1Q03717 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnb1Q03717 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnb1Q03717 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnb1Q03717 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnb1Q03717 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kcnb1Q03717 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kcnb1Q03717 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kcnb1Q03717 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kcnb1Q03717 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnb1Q03717 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnb1Q03717 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnb1Q03717 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnb1Q03717 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnb1Q03717 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kcnb1Q03717 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kcnb1Q03717 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kcnb1Q03717 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Kcnb1Q03717 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kcnb1Q03717 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnb1Q03717 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnb1Q03717 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnb1Q03717 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnb1Q03717 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnb1Q03717 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnb1Q03717 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnb1Q03717 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnb1Q03717 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnb1Q03717 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcnb1Q03717 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcnb1Q03717 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcnb1Q03717 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcnb1Q03717 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcnb1Q03717 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcnb1Q03717 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcnb1Q03717 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcnb1Q03717 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcnb1Q03717 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcnb1Q03717 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcnb1Q03717 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnb1Q03717 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcnb1Q03717 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kcnb1Q03717 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kcnb1Q03717 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnb1Q03717 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnb1Q03717 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnb1Q03717 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnb1Q03717 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcnb1Q03717 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcnb1Q03717 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcnb1Q03717 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnb1Q03717 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnb1Q03717 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnb1Q03717 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnb1Q03717 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnb1Q03717 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnb1Q03717 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnb1Q03717 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnb1Q03717 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnb1Q03717 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kcnb1Q03717 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kcnb1Q03717 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kcnb1Q03717 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kcnb1Q03717 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnb1Q03717 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnb1Q03717 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnb1Q03717 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnb1Q03717 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnb1Q03717 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms