Protein–RNA interactions for Protein: Q03147

Cdk7, Cyclin-dependent kinase 7, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk7Q03147 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk7Q03147 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cdk7Q03147 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cdk7Q03147 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cdk7Q03147 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk7Q03147 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk7Q03147 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk7Q03147 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk7Q03147 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk7Q03147 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk7Q03147 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdk7Q03147 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdk7Q03147 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdk7Q03147 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk7Q03147 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk7Q03147 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk7Q03147 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk7Q03147 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk7Q03147 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk7Q03147 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk7Q03147 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk7Q03147 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk7Q03147 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk7Q03147 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk7Q03147 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk7Q03147 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk7Q03147 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk7Q03147 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk7Q03147 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk7Q03147 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk7Q03147 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk7Q03147 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk7Q03147 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk7Q03147 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk7Q03147 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk7Q03147 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk7Q03147 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk7Q03147 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk7Q03147 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk7Q03147 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk7Q03147 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk7Q03147 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk7Q03147 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk7Q03147 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk7Q03147 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk7Q03147 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk7Q03147 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk7Q03147 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk7Q03147 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk7Q03147 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk7Q03147 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk7Q03147 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk7Q03147 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk7Q03147 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk7Q03147 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk7Q03147 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk7Q03147 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk7Q03147 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk7Q03147 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk7Q03147 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk7Q03147 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk7Q03147 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk7Q03147 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk7Q03147 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk7Q03147 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk7Q03147 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk7Q03147 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk7Q03147 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk7Q03147 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk7Q03147 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk7Q03147 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk7Q03147 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk7Q03147 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk7Q03147 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk7Q03147 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk7Q03147 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk7Q03147 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk7Q03147 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk7Q03147 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk7Q03147 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk7Q03147 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk7Q03147 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk7Q03147 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk7Q03147 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk7Q03147 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk7Q03147 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdk7Q03147 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdk7Q03147 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk7Q03147 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk7Q03147 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk7Q03147 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk7Q03147 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk7Q03147 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk7Q03147 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk7Q03147 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk7Q03147 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms