Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctnnb1Q02248 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctnnb1Q02248 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctnnb1Q02248 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctnnb1Q02248 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctnnb1Q02248 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctnnb1Q02248 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctnnb1Q02248 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctnnb1Q02248 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnnb1Q02248 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnnb1Q02248 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnnb1Q02248 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnnb1Q02248 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnnb1Q02248 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctnnb1Q02248 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctnnb1Q02248 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctnnb1Q02248 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctnnb1Q02248 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctnnb1Q02248 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctnnb1Q02248 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctnnb1Q02248 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctnnb1Q02248 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctnnb1Q02248 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctnnb1Q02248 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctnnb1Q02248 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctnnb1Q02248 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctnnb1Q02248 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctnnb1Q02248 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctnnb1Q02248 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctnnb1Q02248 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctnnb1Q02248 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctnnb1Q02248 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctnnb1Q02248 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctnnb1Q02248 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctnnb1Q02248 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ctnnb1Q02248 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctnnb1Q02248 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctnnb1Q02248 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctnnb1Q02248 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctnnb1Q02248 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctnnb1Q02248 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctnnb1Q02248 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctnnb1Q02248 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctnnb1Q02248 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctnnb1Q02248 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctnnb1Q02248 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctnnb1Q02248 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctnnb1Q02248 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctnnb1Q02248 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctnnb1Q02248 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctnnb1Q02248 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctnnb1Q02248 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctnnb1Q02248 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctnnb1Q02248 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctnnb1Q02248 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctnnb1Q02248 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctnnb1Q02248 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctnnb1Q02248 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctnnb1Q02248 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctnnb1Q02248 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctnnb1Q02248 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctnnb1Q02248 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctnnb1Q02248 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctnnb1Q02248 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctnnb1Q02248 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctnnb1Q02248 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctnnb1Q02248 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctnnb1Q02248 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctnnb1Q02248 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctnnb1Q02248 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctnnb1Q02248 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctnnb1Q02248 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctnnb1Q02248 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnnb1Q02248 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnnb1Q02248 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnnb1Q02248 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnnb1Q02248 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnnb1Q02248 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnnb1Q02248 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnnb1Q02248 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctnnb1Q02248 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctnnb1Q02248 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctnnb1Q02248 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctnnb1Q02248 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctnnb1Q02248 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctnnb1Q02248 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctnnb1Q02248 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctnnb1Q02248 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctnnb1Q02248 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctnnb1Q02248 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctnnb1Q02248 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctnnb1Q02248 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctnnb1Q02248 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctnnb1Q02248 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctnnb1Q02248 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctnnb1Q02248 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctnnb1Q02248 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctnnb1Q02248 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctnnb1Q02248 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctnnb1Q02248 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms