Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RykQ01887 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RykQ01887 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RykQ01887 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RykQ01887 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RykQ01887 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RykQ01887 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RykQ01887 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RykQ01887 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RykQ01887 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RykQ01887 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RykQ01887 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RykQ01887 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RykQ01887 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RykQ01887 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RykQ01887 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RykQ01887 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RykQ01887 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RykQ01887 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RykQ01887 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RykQ01887 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RykQ01887 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RykQ01887 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RykQ01887 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RykQ01887 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RykQ01887 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RykQ01887 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RykQ01887 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RykQ01887 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RykQ01887 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RykQ01887 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RykQ01887 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RykQ01887 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RykQ01887 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RykQ01887 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RykQ01887 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RykQ01887 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RykQ01887 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RykQ01887 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RykQ01887 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RykQ01887 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RykQ01887 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RykQ01887 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RykQ01887 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RykQ01887 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RykQ01887 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RykQ01887 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RykQ01887 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RykQ01887 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RykQ01887 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RykQ01887 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RykQ01887 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RykQ01887 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RykQ01887 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RykQ01887 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RykQ01887 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RykQ01887 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RykQ01887 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RykQ01887 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RykQ01887 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RykQ01887 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RykQ01887 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RykQ01887 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RykQ01887 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RykQ01887 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RykQ01887 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RykQ01887 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RykQ01887 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RykQ01887 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RykQ01887 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RykQ01887 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RykQ01887 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RykQ01887 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RykQ01887 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RykQ01887 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RykQ01887 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RykQ01887 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RykQ01887 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RykQ01887 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RykQ01887 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RykQ01887 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RykQ01887 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RykQ01887 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RykQ01887 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RykQ01887 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RykQ01887 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RykQ01887 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RykQ01887 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RykQ01887 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RykQ01887 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RykQ01887 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RykQ01887 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RykQ01887 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RykQ01887 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RykQ01887 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RykQ01887 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RykQ01887 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RykQ01887 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RykQ01887 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RykQ01887 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms