Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna1cQ01815 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1cQ01815 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna1cQ01815 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna1cQ01815 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna1cQ01815 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna1cQ01815 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna1cQ01815 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1cQ01815 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna1cQ01815 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna1cQ01815 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna1cQ01815 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna1cQ01815 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna1cQ01815 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cacna1cQ01815 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cacna1cQ01815 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1cQ01815 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1cQ01815 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1cQ01815 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1cQ01815 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1cQ01815 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1cQ01815 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna1cQ01815 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1cQ01815 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1cQ01815 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1cQ01815 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1cQ01815 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1cQ01815 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna1cQ01815 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna1cQ01815 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna1cQ01815 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna1cQ01815 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna1cQ01815 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna1cQ01815 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1cQ01815 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna1cQ01815 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1cQ01815 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1cQ01815 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacna1cQ01815 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cacna1cQ01815 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1cQ01815 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1cQ01815 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacna1cQ01815 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1cQ01815 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1cQ01815 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1cQ01815 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1cQ01815 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1cQ01815 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna1cQ01815 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna1cQ01815 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1cQ01815 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1cQ01815 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1cQ01815 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1cQ01815 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1cQ01815 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1cQ01815 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna1cQ01815 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1cQ01815 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1cQ01815 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1cQ01815 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1cQ01815 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1cQ01815 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna1cQ01815 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cacna1cQ01815 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cacna1cQ01815 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna1cQ01815 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1cQ01815 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1cQ01815 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1cQ01815 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1cQ01815 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms