Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PrcdQ00LT2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrcdQ00LT2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrcdQ00LT2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrcdQ00LT2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PrcdQ00LT2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrcdQ00LT2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrcdQ00LT2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrcdQ00LT2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrcdQ00LT2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrcdQ00LT2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrcdQ00LT2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrcdQ00LT2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrcdQ00LT2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrcdQ00LT2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PrcdQ00LT2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrcdQ00LT2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrcdQ00LT2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrcdQ00LT2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrcdQ00LT2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PrcdQ00LT2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms