Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itga4Q00651 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itga4Q00651 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itga4Q00651 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itga4Q00651 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itga4Q00651 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itga4Q00651 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itga4Q00651 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itga4Q00651 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itga4Q00651 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itga4Q00651 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itga4Q00651 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itga4Q00651 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga4Q00651 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga4Q00651 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga4Q00651 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga4Q00651 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga4Q00651 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga4Q00651 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga4Q00651 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga4Q00651 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga4Q00651 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga4Q00651 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga4Q00651 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga4Q00651 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga4Q00651 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga4Q00651 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga4Q00651 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga4Q00651 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga4Q00651 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga4Q00651 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga4Q00651 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itga4Q00651 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itga4Q00651 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itga4Q00651 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itga4Q00651 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itga4Q00651 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga4Q00651 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga4Q00651 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga4Q00651 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga4Q00651 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga4Q00651 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga4Q00651 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga4Q00651 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga4Q00651 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga4Q00651 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga4Q00651 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itga4Q00651 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itga4Q00651 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Itga4Q00651 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itga4Q00651 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itga4Q00651 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itga4Q00651 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Itga4Q00651 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itga4Q00651 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itga4Q00651 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga4Q00651 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga4Q00651 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga4Q00651 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Itga4Q00651 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Itga4Q00651 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itga4Q00651 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itga4Q00651 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga4Q00651 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga4Q00651 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Itga4Q00651 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga4Q00651 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga4Q00651 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga4Q00651 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga4Q00651 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga4Q00651 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga4Q00651 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga4Q00651 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga4Q00651 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga4Q00651 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga4Q00651 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga4Q00651 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga4Q00651 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga4Q00651 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga4Q00651 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga4Q00651 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga4Q00651 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga4Q00651 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Itga4Q00651 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Itga4Q00651 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga4Q00651 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga4Q00651 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga4Q00651 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga4Q00651 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga4Q00651 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga4Q00651 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga4Q00651 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga4Q00651 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga4Q00651 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga4Q00651 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga4Q00651 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga4Q00651 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga4Q00651 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga4Q00651 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga4Q00651 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms