Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cds1P98191 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cds1P98191 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cds1P98191 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cds1P98191 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cds1P98191 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cds1P98191 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cds1P98191 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cds1P98191 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cds1P98191 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cds1P98191 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cds1P98191 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cds1P98191 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cds1P98191 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cds1P98191 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cds1P98191 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cds1P98191 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cds1P98191 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cds1P98191 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cds1P98191 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cds1P98191 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cds1P98191 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cds1P98191 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cds1P98191 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cds1P98191 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cds1P98191 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cds1P98191 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cds1P98191 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cds1P98191 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cds1P98191 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cds1P98191 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cds1P98191 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cds1P98191 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cds1P98191 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cds1P98191 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cds1P98191 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cds1P98191 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cds1P98191 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cds1P98191 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cds1P98191 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cds1P98191 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cds1P98191 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cds1P98191 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cds1P98191 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cds1P98191 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cds1P98191 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cds1P98191 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cds1P98191 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cds1P98191 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cds1P98191 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cds1P98191 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cds1P98191 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cds1P98191 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cds1P98191 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cds1P98191 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cds1P98191 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cds1P98191 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cds1P98191 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cds1P98191 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cds1P98191 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cds1P98191 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cds1P98191 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cds1P98191 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cds1P98191 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cds1P98191 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cds1P98191 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cds1P98191 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cds1P98191 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cds1P98191 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cds1P98191 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cds1P98191 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cds1P98191 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cds1P98191 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cds1P98191 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cds1P98191 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cds1P98191 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cds1P98191 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cds1P98191 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cds1P98191 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cds1P98191 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cds1P98191 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cds1P98191 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cds1P98191 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cds1P98191 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cds1P98191 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cds1P98191 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cds1P98191 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cds1P98191 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cds1P98191 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cds1P98191 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cds1P98191 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cds1P98191 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cds1P98191 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cds1P98191 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cds1P98191 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cds1P98191 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cds1P98191 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cds1P98191 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cds1P98191 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cds1P98191 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms