Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lama4P97927 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lama4P97927 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lama4P97927 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lama4P97927 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lama4P97927 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lama4P97927 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Lama4P97927 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Lama4P97927 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Lama4P97927 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lama4P97927 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lama4P97927 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lama4P97927 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lama4P97927 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lama4P97927 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Lama4P97927 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Lama4P97927 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lama4P97927 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lama4P97927 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lama4P97927 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lama4P97927 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lama4P97927 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lama4P97927 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lama4P97927 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lama4P97927 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lama4P97927 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lama4P97927 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lama4P97927 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Lama4P97927 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lama4P97927 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lama4P97927 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lama4P97927 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lama4P97927 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lama4P97927 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lama4P97927 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lama4P97927 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lama4P97927 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lama4P97927 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lama4P97927 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lama4P97927 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lama4P97927 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lama4P97927 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lama4P97927 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Lama4P97927 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lama4P97927 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lama4P97927 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lama4P97927 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lama4P97927 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lama4P97927 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lama4P97927 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lama4P97927 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lama4P97927 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lama4P97927 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lama4P97927 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lama4P97927 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lama4P97927 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lama4P97927 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lama4P97927 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lama4P97927 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lama4P97927 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lama4P97927 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Lama4P97927 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lama4P97927 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Lama4P97927 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lama4P97927 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lama4P97927 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lama4P97927 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lama4P97927 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lama4P97927 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lama4P97927 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lama4P97927 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lama4P97927 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Lama4P97927 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Lama4P97927 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lama4P97927 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lama4P97927 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lama4P97927 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Lama4P97927 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lama4P97927 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lama4P97927 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lama4P97927 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lama4P97927 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lama4P97927 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lama4P97927 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lama4P97927 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lama4P97927 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lama4P97927 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lama4P97927 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lama4P97927 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lama4P97927 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Lama4P97927 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lama4P97927 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lama4P97927 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lama4P97927 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lama4P97927 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lama4P97927 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lama4P97927 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lama4P97927 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lama4P97927 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lama4P97927 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms