Protein–RNA interactions for Protein: P97427

Crmp1, Dihydropyrimidinase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crmp1P97427 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Crmp1P97427 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Crmp1P97427 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Crmp1P97427 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Crmp1P97427 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Crmp1P97427 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Crmp1P97427 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Crmp1P97427 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Crmp1P97427 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Crmp1P97427 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Crmp1P97427 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Crmp1P97427 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Crmp1P97427 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Crmp1P97427 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Crmp1P97427 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Crmp1P97427 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Crmp1P97427 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Crmp1P97427 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Crmp1P97427 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Crmp1P97427 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Crmp1P97427 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Crmp1P97427 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Crmp1P97427 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Crmp1P97427 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Crmp1P97427 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Crmp1P97427 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Crmp1P97427 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms