Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mesp1P97309 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mesp1P97309 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Mesp1P97309 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Mesp1P97309 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mesp1P97309 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mesp1P97309 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mesp1P97309 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mesp1P97309 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mesp1P97309 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mesp1P97309 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mesp1P97309 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mesp1P97309 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Mesp1P97309 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mesp1P97309 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mesp1P97309 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Mesp1P97309 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mesp1P97309 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mesp1P97309 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mesp1P97309 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mesp1P97309 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Mesp1P97309 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mesp1P97309 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mesp1P97309 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mesp1P97309 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mesp1P97309 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mesp1P97309 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mesp1P97309 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mesp1P97309 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mesp1P97309 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mesp1P97309 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mesp1P97309 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mesp1P97309 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mesp1P97309 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mesp1P97309 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mesp1P97309 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Mesp1P97309 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mesp1P97309 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mesp1P97309 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Mesp1P97309 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mesp1P97309 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Mesp1P97309 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mesp1P97309 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms