Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Irx3P81067 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Irx3P81067 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Irx3P81067 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Irx3P81067 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Irx3P81067 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Irx3P81067 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Irx3P81067 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Irx3P81067 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Irx3P81067 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Irx3P81067 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Irx3P81067 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Irx3P81067 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Irx3P81067 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Irx3P81067 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Irx3P81067 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Irx3P81067 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Irx3P81067 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Irx3P81067 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Irx3P81067 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Irx3P81067 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Irx3P81067 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Irx3P81067 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Irx3P81067 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Irx3P81067 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Irx3P81067 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Irx3P81067 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Irx3P81067 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Irx3P81067 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Irx3P81067 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Irx3P81067 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Irx3P81067 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Irx3P81067 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Irx3P81067 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Irx3P81067 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Irx3P81067 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Irx3P81067 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Irx3P81067 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Irx3P81067 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Irx3P81067 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Irx3P81067 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Irx3P81067 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Irx3P81067 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Irx3P81067 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Irx3P81067 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Irx3P81067 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Irx3P81067 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Irx3P81067 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Irx3P81067 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Irx3P81067 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Irx3P81067 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Irx3P81067 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Irx3P81067 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Irx3P81067 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Irx3P81067 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Irx3P81067 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Irx3P81067 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Irx3P81067 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Irx3P81067 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Irx3P81067 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Irx3P81067 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Irx3P81067 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Irx3P81067 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Irx3P81067 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Irx3P81067 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Irx3P81067 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Irx3P81067 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Irx3P81067 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Irx3P81067 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Irx3P81067 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Irx3P81067 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Irx3P81067 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Irx3P81067 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Irx3P81067 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Irx3P81067 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Irx3P81067 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Irx3P81067 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Irx3P81067 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Irx3P81067 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Irx3P81067 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Irx3P81067 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Irx3P81067 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Irx3P81067 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Irx3P81067 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Irx3P81067 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Irx3P81067 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Irx3P81067 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Irx3P81067 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Irx3P81067 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Irx3P81067 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Irx3P81067 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Irx3P81067 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Irx3P81067 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Irx3P81067 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Irx3P81067 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Irx3P81067 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Irx3P81067 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Irx3P81067 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Irx3P81067 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Irx3P81067 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms