Protein–RNA interactions for Protein: P80317

Cct6a, T-complex protein 1 subunit zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct6aP80317 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cct6aP80317 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cct6aP80317 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cct6aP80317 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cct6aP80317 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cct6aP80317 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cct6aP80317 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cct6aP80317 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cct6aP80317 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cct6aP80317 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cct6aP80317 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cct6aP80317 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cct6aP80317 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cct6aP80317 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cct6aP80317 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cct6aP80317 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cct6aP80317 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cct6aP80317 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cct6aP80317 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cct6aP80317 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cct6aP80317 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cct6aP80317 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cct6aP80317 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cct6aP80317 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cct6aP80317 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cct6aP80317 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cct6aP80317 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cct6aP80317 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cct6aP80317 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cct6aP80317 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cct6aP80317 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cct6aP80317 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cct6aP80317 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cct6aP80317 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cct6aP80317 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cct6aP80317 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cct6aP80317 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cct6aP80317 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cct6aP80317 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cct6aP80317 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cct6aP80317 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cct6aP80317 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cct6aP80317 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cct6aP80317 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cct6aP80317 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cct6aP80317 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cct6aP80317 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cct6aP80317 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cct6aP80317 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cct6aP80317 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cct6aP80317 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cct6aP80317 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cct6aP80317 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cct6aP80317 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cct6aP80317 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cct6aP80317 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cct6aP80317 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cct6aP80317 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cct6aP80317 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cct6aP80317 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cct6aP80317 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cct6aP80317 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cct6aP80317 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cct6aP80317 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cct6aP80317 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cct6aP80317 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cct6aP80317 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cct6aP80317 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cct6aP80317 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cct6aP80317 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cct6aP80317 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cct6aP80317 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cct6aP80317 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cct6aP80317 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cct6aP80317 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cct6aP80317 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cct6aP80317 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cct6aP80317 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cct6aP80317 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cct6aP80317 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cct6aP80317 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cct6aP80317 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cct6aP80317 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cct6aP80317 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cct6aP80317 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cct6aP80317 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cct6aP80317 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cct6aP80317 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cct6aP80317 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cct6aP80317 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cct6aP80317 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cct6aP80317 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cct6aP80317 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cct6aP80317 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cct6aP80317 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cct6aP80317 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cct6aP80317 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cct6aP80317 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cct6aP80317 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cct6aP80317 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms