Protein–RNA interactions for Protein: P80314

Cct2, T-complex protein 1 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct2P80314 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cct2P80314 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cct2P80314 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cct2P80314 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cct2P80314 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cct2P80314 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cct2P80314 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cct2P80314 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cct2P80314 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cct2P80314 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cct2P80314 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cct2P80314 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cct2P80314 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Cct2P80314 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Cct2P80314 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cct2P80314 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cct2P80314 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cct2P80314 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cct2P80314 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cct2P80314 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cct2P80314 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cct2P80314 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cct2P80314 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cct2P80314 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cct2P80314 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cct2P80314 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cct2P80314 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cct2P80314 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cct2P80314 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cct2P80314 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cct2P80314 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cct2P80314 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cct2P80314 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cct2P80314 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cct2P80314 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cct2P80314 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cct2P80314 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cct2P80314 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cct2P80314 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cct2P80314 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cct2P80314 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cct2P80314 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cct2P80314 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cct2P80314 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cct2P80314 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cct2P80314 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cct2P80314 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cct2P80314 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cct2P80314 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cct2P80314 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cct2P80314 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cct2P80314 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cct2P80314 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cct2P80314 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cct2P80314 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cct2P80314 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cct2P80314 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cct2P80314 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cct2P80314 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cct2P80314 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cct2P80314 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cct2P80314 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cct2P80314 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Cct2P80314 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cct2P80314 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cct2P80314 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cct2P80314 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cct2P80314 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cct2P80314 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cct2P80314 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cct2P80314 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cct2P80314 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cct2P80314 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cct2P80314 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cct2P80314 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cct2P80314 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cct2P80314 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cct2P80314 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cct2P80314 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cct2P80314 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cct2P80314 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cct2P80314 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cct2P80314 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Cct2P80314 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cct2P80314 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cct2P80314 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cct2P80314 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cct2P80314 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cct2P80314 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cct2P80314 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cct2P80314 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cct2P80314 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cct2P80314 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cct2P80314 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cct2P80314 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Cct2P80314 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cct2P80314 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cct2P80314 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cct2P80314 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cct2P80314 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms