Protein–RNA interactions for Protein: P70697

Urod, Uroporphyrinogen decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UrodP70697 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UrodP70697 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UrodP70697 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UrodP70697 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UrodP70697 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UrodP70697 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UrodP70697 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UrodP70697 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UrodP70697 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UrodP70697 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UrodP70697 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UrodP70697 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UrodP70697 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UrodP70697 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UrodP70697 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UrodP70697 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UrodP70697 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UrodP70697 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UrodP70697 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UrodP70697 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UrodP70697 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UrodP70697 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UrodP70697 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UrodP70697 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UrodP70697 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UrodP70697 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UrodP70697 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UrodP70697 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UrodP70697 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UrodP70697 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UrodP70697 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UrodP70697 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UrodP70697 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UrodP70697 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UrodP70697 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UrodP70697 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UrodP70697 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UrodP70697 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UrodP70697 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UrodP70697 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UrodP70697 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UrodP70697 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UrodP70697 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UrodP70697 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UrodP70697 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UrodP70697 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UrodP70697 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UrodP70697 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UrodP70697 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UrodP70697 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UrodP70697 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UrodP70697 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UrodP70697 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UrodP70697 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UrodP70697 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UrodP70697 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UrodP70697 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UrodP70697 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UrodP70697 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UrodP70697 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UrodP70697 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UrodP70697 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UrodP70697 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UrodP70697 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UrodP70697 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UrodP70697 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UrodP70697 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UrodP70697 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UrodP70697 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UrodP70697 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UrodP70697 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UrodP70697 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UrodP70697 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UrodP70697 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UrodP70697 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UrodP70697 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UrodP70697 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UrodP70697 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UrodP70697 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UrodP70697 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UrodP70697 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UrodP70697 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UrodP70697 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UrodP70697 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UrodP70697 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UrodP70697 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UrodP70697 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UrodP70697 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UrodP70697 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UrodP70697 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UrodP70697 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UrodP70697 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UrodP70697 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UrodP70697 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UrodP70697 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UrodP70697 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UrodP70697 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UrodP70697 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UrodP70697 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UrodP70697 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms