Protein–RNA interactions for Protein: P70408

Cdh10, Cadherin-10, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh10P70408 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdh10P70408 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdh10P70408 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdh10P70408 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdh10P70408 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdh10P70408 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdh10P70408 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cdh10P70408 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdh10P70408 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdh10P70408 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdh10P70408 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdh10P70408 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdh10P70408 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdh10P70408 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cdh10P70408 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdh10P70408 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdh10P70408 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdh10P70408 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cdh10P70408 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdh10P70408 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdh10P70408 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdh10P70408 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdh10P70408 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdh10P70408 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdh10P70408 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdh10P70408 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdh10P70408 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdh10P70408 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdh10P70408 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdh10P70408 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdh10P70408 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdh10P70408 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdh10P70408 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdh10P70408 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdh10P70408 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdh10P70408 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdh10P70408 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdh10P70408 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdh10P70408 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdh10P70408 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdh10P70408 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdh10P70408 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdh10P70408 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdh10P70408 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdh10P70408 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdh10P70408 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cdh10P70408 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cdh10P70408 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdh10P70408 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdh10P70408 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdh10P70408 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdh10P70408 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdh10P70408 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdh10P70408 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdh10P70408 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdh10P70408 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdh10P70408 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdh10P70408 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdh10P70408 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdh10P70408 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdh10P70408 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdh10P70408 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdh10P70408 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdh10P70408 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdh10P70408 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms