Protein–RNA interactions for Protein: P70295

Aup1, Ancient ubiquitous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aup1P70295 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aup1P70295 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aup1P70295 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aup1P70295 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aup1P70295 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aup1P70295 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Aup1P70295 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aup1P70295 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aup1P70295 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aup1P70295 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aup1P70295 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aup1P70295 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Aup1P70295 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aup1P70295 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aup1P70295 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Aup1P70295 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aup1P70295 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aup1P70295 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aup1P70295 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aup1P70295 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Aup1P70295 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aup1P70295 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aup1P70295 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aup1P70295 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aup1P70295 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Aup1P70295 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aup1P70295 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aup1P70295 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aup1P70295 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aup1P70295 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aup1P70295 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aup1P70295 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aup1P70295 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aup1P70295 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aup1P70295 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aup1P70295 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aup1P70295 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aup1P70295 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aup1P70295 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aup1P70295 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aup1P70295 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Aup1P70295 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aup1P70295 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aup1P70295 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aup1P70295 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aup1P70295 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aup1P70295 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aup1P70295 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aup1P70295 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Aup1P70295 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aup1P70295 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aup1P70295 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aup1P70295 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aup1P70295 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aup1P70295 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aup1P70295 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aup1P70295 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aup1P70295 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aup1P70295 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aup1P70295 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aup1P70295 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aup1P70295 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aup1P70295 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aup1P70295 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aup1P70295 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Aup1P70295 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aup1P70295 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aup1P70295 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aup1P70295 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aup1P70295 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Aup1P70295 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aup1P70295 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aup1P70295 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Aup1P70295 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Aup1P70295 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Aup1P70295 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aup1P70295 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aup1P70295 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aup1P70295 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Aup1P70295 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aup1P70295 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Aup1P70295 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aup1P70295 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aup1P70295 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aup1P70295 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aup1P70295 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aup1P70295 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aup1P70295 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aup1P70295 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aup1P70295 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aup1P70295 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aup1P70295 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aup1P70295 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aup1P70295 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aup1P70295 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aup1P70295 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aup1P70295 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Aup1P70295 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aup1P70295 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aup1P70295 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms