Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NfixP70257 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NfixP70257 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NfixP70257 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NfixP70257 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NfixP70257 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NfixP70257 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NfixP70257 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NfixP70257 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NfixP70257 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NfixP70257 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NfixP70257 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NfixP70257 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NfixP70257 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NfixP70257 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NfixP70257 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NfixP70257 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NfixP70257 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NfixP70257 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NfixP70257 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NfixP70257 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NfixP70257 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NfixP70257 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NfixP70257 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NfixP70257 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NfixP70257 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NfixP70257 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NfixP70257 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NfixP70257 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NfixP70257 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NfixP70257 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NfixP70257 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NfixP70257 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NfixP70257 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NfixP70257 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NfixP70257 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NfixP70257 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NfixP70257 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NfixP70257 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NfixP70257 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NfixP70257 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NfixP70257 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NfixP70257 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NfixP70257 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NfixP70257 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NfixP70257 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NfixP70257 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NfixP70257 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NfixP70257 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NfixP70257 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NfixP70257 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NfixP70257 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NfixP70257 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NfixP70257 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NfixP70257 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NfixP70257 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NfixP70257 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NfixP70257 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NfixP70257 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NfixP70257 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NfixP70257 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NfixP70257 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NfixP70257 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NfixP70257 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NfixP70257 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NfixP70257 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NfixP70257 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NfixP70257 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NfixP70257 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NfixP70257 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NfixP70257 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NfixP70257 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NfixP70257 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NfixP70257 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NfixP70257 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NfixP70257 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NfixP70257 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NfixP70257 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NfixP70257 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NfixP70257 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NfixP70257 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NfixP70257 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NfixP70257 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NfixP70257 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NfixP70257 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NfixP70257 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NfixP70257 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NfixP70257 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NfixP70257 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NfixP70257 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NfixP70257 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NfixP70257 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NfixP70257 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NfixP70257 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NfixP70257 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NfixP70257 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NfixP70257 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NfixP70257 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NfixP70257 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NfixP70257 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms