Protein–RNA interactions for Protein: P70248

Myo1f, Unconventional myosin-If, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1fP70248 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Myo1fP70248 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Myo1fP70248 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Myo1fP70248 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Myo1fP70248 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Myo1fP70248 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Myo1fP70248 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Myo1fP70248 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Myo1fP70248 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Myo1fP70248 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Myo1fP70248 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Myo1fP70248 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Myo1fP70248 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Myo1fP70248 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Myo1fP70248 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Myo1fP70248 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Myo1fP70248 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Myo1fP70248 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Myo1fP70248 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Myo1fP70248 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Myo1fP70248 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Myo1fP70248 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Myo1fP70248 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Myo1fP70248 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Myo1fP70248 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Myo1fP70248 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Myo1fP70248 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Myo1fP70248 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Myo1fP70248 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Myo1fP70248 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Myo1fP70248 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Myo1fP70248 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Myo1fP70248 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Myo1fP70248 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Myo1fP70248 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Myo1fP70248 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Myo1fP70248 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Myo1fP70248 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Myo1fP70248 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Myo1fP70248 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Myo1fP70248 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Myo1fP70248 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Myo1fP70248 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Myo1fP70248 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Myo1fP70248 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Myo1fP70248 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Myo1fP70248 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Myo1fP70248 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Myo1fP70248 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Myo1fP70248 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Myo1fP70248 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Myo1fP70248 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Myo1fP70248 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Myo1fP70248 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Myo1fP70248 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Myo1fP70248 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Myo1fP70248 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Myo1fP70248 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Myo1fP70248 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Myo1fP70248 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Myo1fP70248 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Myo1fP70248 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Myo1fP70248 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Myo1fP70248 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Myo1fP70248 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Myo1fP70248 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Myo1fP70248 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Myo1fP70248 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo1fP70248 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo1fP70248 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo1fP70248 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo1fP70248 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo1fP70248 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo1fP70248 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Myo1fP70248 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Myo1fP70248 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Myo1fP70248 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Myo1fP70248 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Myo1fP70248 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Myo1fP70248 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Myo1fP70248 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myo1fP70248 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myo1fP70248 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myo1fP70248 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myo1fP70248 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myo1fP70248 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myo1fP70248 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Myo1fP70248 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Myo1fP70248 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Myo1fP70248 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Myo1fP70248 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myo1fP70248 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myo1fP70248 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myo1fP70248 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Myo1fP70248 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Myo1fP70248 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Myo1fP70248 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myo1fP70248 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myo1fP70248 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myo1fP70248 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms