Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf6P70196 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf6P70196 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf6P70196 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf6P70196 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf6P70196 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf6P70196 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf6P70196 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf6P70196 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf6P70196 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf6P70196 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf6P70196 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf6P70196 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf6P70196 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf6P70196 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf6P70196 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf6P70196 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf6P70196 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf6P70196 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf6P70196 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf6P70196 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf6P70196 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf6P70196 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf6P70196 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf6P70196 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf6P70196 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf6P70196 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf6P70196 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf6P70196 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf6P70196 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Traf6P70196 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf6P70196 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf6P70196 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf6P70196 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Traf6P70196 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf6P70196 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Traf6P70196 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf6P70196 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Traf6P70196 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Traf6P70196 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf6P70196 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf6P70196 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Traf6P70196 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf6P70196 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf6P70196 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf6P70196 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf6P70196 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf6P70196 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Traf6P70196 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf6P70196 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf6P70196 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf6P70196 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf6P70196 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf6P70196 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Traf6P70196 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf6P70196 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf6P70196 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf6P70196 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf6P70196 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Traf6P70196 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Traf6P70196 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf6P70196 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf6P70196 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Traf6P70196 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf6P70196 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf6P70196 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf6P70196 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf6P70196 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf6P70196 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf6P70196 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf6P70196 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf6P70196 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf6P70196 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf6P70196 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf6P70196 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf6P70196 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf6P70196 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf6P70196 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Traf6P70196 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf6P70196 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf6P70196 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf6P70196 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf6P70196 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf6P70196 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Traf6P70196 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Traf6P70196 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf6P70196 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf6P70196 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf6P70196 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf6P70196 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf6P70196 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf6P70196 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf6P70196 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf6P70196 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf6P70196 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf6P70196 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf6P70196 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf6P70196 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf6P70196 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf6P70196 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123 ms