Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gabrb3P63080 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gabrb3P63080 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gabrb3P63080 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gabrb3P63080 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gabrb3P63080 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gabrb3P63080 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gabrb3P63080 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gabrb3P63080 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gabrb3P63080 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gabrb3P63080 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gabrb3P63080 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gabrb3P63080 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gabrb3P63080 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gabrb3P63080 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gabrb3P63080 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gabrb3P63080 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gabrb3P63080 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabrb3P63080 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabrb3P63080 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabrb3P63080 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabrb3P63080 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabrb3P63080 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabrb3P63080 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabrb3P63080 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gabrb3P63080 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gabrb3P63080 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gabrb3P63080 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gabrb3P63080 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gabrb3P63080 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabrb3P63080 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabrb3P63080 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabrb3P63080 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabrb3P63080 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabrb3P63080 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabrb3P63080 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabrb3P63080 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabrb3P63080 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabrb3P63080 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabrb3P63080 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabrb3P63080 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gabrb3P63080 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gabrb3P63080 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gabrb3P63080 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gabrb3P63080 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabrb3P63080 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabrb3P63080 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabrb3P63080 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabrb3P63080 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabrb3P63080 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabrb3P63080 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabrb3P63080 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabrb3P63080 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabrb3P63080 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabrb3P63080 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gabrb3P63080 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabrb3P63080 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabrb3P63080 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabrb3P63080 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabrb3P63080 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabrb3P63080 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabrb3P63080 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabrb3P63080 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabrb3P63080 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabrb3P63080 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabrb3P63080 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabrb3P63080 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabrb3P63080 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms