Protein–RNA interactions for Protein: P62918

Rpl8, 60S ribosomal protein L8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl8P62918 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rpl8P62918 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl8P62918 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl8P62918 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms