Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lsm5P62322 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lsm5P62322 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lsm5P62322 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lsm5P62322 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lsm5P62322 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm5P62322 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm5P62322 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm5P62322 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm5P62322 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm5P62322 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lsm5P62322 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lsm5P62322 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lsm5P62322 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lsm5P62322 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lsm5P62322 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lsm5P62322 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lsm5P62322 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lsm5P62322 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lsm5P62322 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lsm5P62322 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lsm5P62322 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lsm5P62322 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lsm5P62322 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lsm5P62322 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lsm5P62322 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lsm5P62322 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lsm5P62322 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lsm5P62322 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lsm5P62322 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lsm5P62322 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lsm5P62322 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsm5P62322 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lsm5P62322 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms