Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme3P61290 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme3P61290 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme3P61290 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme3P61290 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psme3P61290 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psme3P61290 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psme3P61290 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psme3P61290 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psme3P61290 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psme3P61290 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme3P61290 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme3P61290 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme3P61290 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme3P61290 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme3P61290 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme3P61290 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psme3P61290 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme3P61290 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme3P61290 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme3P61290 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme3P61290 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme3P61290 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psme3P61290 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psme3P61290 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psme3P61290 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psme3P61290 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psme3P61290 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psme3P61290 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psme3P61290 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Psme3P61290 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psme3P61290 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psme3P61290 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psme3P61290 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psme3P61290 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psme3P61290 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psme3P61290 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psme3P61290 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psme3P61290 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Psme3P61290 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psme3P61290 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psme3P61290 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psme3P61290 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psme3P61290 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psme3P61290 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psme3P61290 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psme3P61290 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psme3P61290 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psme3P61290 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psme3P61290 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psme3P61290 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psme3P61290 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psme3P61290 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psme3P61290 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psme3P61290 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psme3P61290 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Psme3P61290 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Psme3P61290 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psme3P61290 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psme3P61290 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psme3P61290 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psme3P61290 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psme3P61290 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms