Protein–RNA interactions for Protein: P61079

Ube2d3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d3P61079 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2d3P61079 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d3P61079 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d3P61079 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms