Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdo1P60334 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdo1P60334 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdo1P60334 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdo1P60334 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdo1P60334 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdo1P60334 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdo1P60334 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdo1P60334 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdo1P60334 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdo1P60334 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdo1P60334 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdo1P60334 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdo1P60334 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdo1P60334 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdo1P60334 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdo1P60334 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdo1P60334 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdo1P60334 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdo1P60334 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdo1P60334 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdo1P60334 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdo1P60334 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdo1P60334 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdo1P60334 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdo1P60334 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdo1P60334 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdo1P60334 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdo1P60334 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdo1P60334 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdo1P60334 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdo1P60334 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdo1P60334 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdo1P60334 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdo1P60334 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdo1P60334 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdo1P60334 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdo1P60334 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdo1P60334 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdo1P60334 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdo1P60334 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdo1P60334 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdo1P60334 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdo1P60334 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdo1P60334 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdo1P60334 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdo1P60334 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdo1P60334 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdo1P60334 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdo1P60334 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdo1P60334 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdo1P60334 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdo1P60334 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdo1P60334 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdo1P60334 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdo1P60334 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdo1P60334 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdo1P60334 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdo1P60334 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdo1P60334 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdo1P60334 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdo1P60334 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdo1P60334 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdo1P60334 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cdo1P60334 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cdo1P60334 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdo1P60334 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdo1P60334 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdo1P60334 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdo1P60334 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdo1P60334 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdo1P60334 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdo1P60334 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdo1P60334 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdo1P60334 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdo1P60334 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdo1P60334 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdo1P60334 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdo1P60334 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdo1P60334 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdo1P60334 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdo1P60334 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdo1P60334 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdo1P60334 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdo1P60334 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdo1P60334 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdo1P60334 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdo1P60334 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdo1P60334 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdo1P60334 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdo1P60334 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdo1P60334 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdo1P60334 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdo1P60334 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdo1P60334 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdo1P60334 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdo1P60334 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdo1P60334 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdo1P60334 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdo1P60334 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms