Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hps5P59438 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hps5P59438 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hps5P59438 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hps5P59438 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hps5P59438 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hps5P59438 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hps5P59438 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Hps5P59438 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hps5P59438 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hps5P59438 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Hps5P59438 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hps5P59438 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hps5P59438 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hps5P59438 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hps5P59438 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hps5P59438 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hps5P59438 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hps5P59438 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hps5P59438 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hps5P59438 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hps5P59438 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Hps5P59438 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hps5P59438 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hps5P59438 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hps5P59438 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hps5P59438 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hps5P59438 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hps5P59438 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hps5P59438 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hps5P59438 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hps5P59438 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hps5P59438 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hps5P59438 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hps5P59438 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hps5P59438 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hps5P59438 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hps5P59438 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hps5P59438 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Hps5P59438 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hps5P59438 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hps5P59438 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hps5P59438 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hps5P59438 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hps5P59438 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hps5P59438 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hps5P59438 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hps5P59438 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hps5P59438 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hps5P59438 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hps5P59438 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hps5P59438 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hps5P59438 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hps5P59438 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Hps5P59438 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hps5P59438 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hps5P59438 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hps5P59438 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hps5P59438 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hps5P59438 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hps5P59438 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hps5P59438 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hps5P59438 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hps5P59438 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hps5P59438 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hps5P59438 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hps5P59438 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hps5P59438 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hps5P59438 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hps5P59438 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hps5P59438 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hps5P59438 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hps5P59438 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hps5P59438 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hps5P59438 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Hps5P59438 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Hps5P59438 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Hps5P59438 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hps5P59438 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hps5P59438 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hps5P59438 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hps5P59438 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hps5P59438 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hps5P59438 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Hps5P59438 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hps5P59438 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hps5P59438 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hps5P59438 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hps5P59438 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hps5P59438 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hps5P59438 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hps5P59438 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hps5P59438 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Hps5P59438 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hps5P59438 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hps5P59438 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hps5P59438 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hps5P59438 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hps5P59438 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hps5P59438 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms