Protein–RNA interactions for Protein: P58681

Tlr7, Toll-like receptor 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr7P58681 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Tlr7P58681 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Tlr7P58681 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tlr7P58681 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tlr7P58681 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tlr7P58681 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tlr7P58681 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tlr7P58681 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tlr7P58681 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tlr7P58681 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tlr7P58681 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tlr7P58681 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tlr7P58681 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tlr7P58681 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tlr7P58681 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tlr7P58681 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Tlr7P58681 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tlr7P58681 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tlr7P58681 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tlr7P58681 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tlr7P58681 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tlr7P58681 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Tlr7P58681 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tlr7P58681 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tlr7P58681 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tlr7P58681 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tlr7P58681 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tlr7P58681 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tlr7P58681 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tlr7P58681 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tlr7P58681 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tlr7P58681 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tlr7P58681 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Tlr7P58681 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tlr7P58681 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tlr7P58681 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tlr7P58681 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Tlr7P58681 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tlr7P58681 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tlr7P58681 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tlr7P58681 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tlr7P58681 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tlr7P58681 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tlr7P58681 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tlr7P58681 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tlr7P58681 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tlr7P58681 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Tlr7P58681 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tlr7P58681 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tlr7P58681 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tlr7P58681 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tlr7P58681 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tlr7P58681 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tlr7P58681 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tlr7P58681 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tlr7P58681 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tlr7P58681 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tlr7P58681 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tlr7P58681 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tlr7P58681 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tlr7P58681 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tlr7P58681 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Tlr7P58681 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tlr7P58681 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Tlr7P58681 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tlr7P58681 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tlr7P58681 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Tlr7P58681 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tlr7P58681 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tlr7P58681 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms