Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Uchl4P58321 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uchl4P58321 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uchl4P58321 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Uchl4P58321 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Uchl4P58321 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uchl4P58321 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uchl4P58321 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uchl4P58321 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uchl4P58321 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Uchl4P58321 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Uchl4P58321 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uchl4P58321 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uchl4P58321 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uchl4P58321 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uchl4P58321 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uchl4P58321 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uchl4P58321 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Uchl4P58321 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Uchl4P58321 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Uchl4P58321 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Uchl4P58321 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uchl4P58321 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uchl4P58321 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uchl4P58321 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uchl4P58321 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uchl4P58321 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uchl4P58321 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uchl4P58321 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uchl4P58321 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uchl4P58321 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Uchl4P58321 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uchl4P58321 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uchl4P58321 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uchl4P58321 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uchl4P58321 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uchl4P58321 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uchl4P58321 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uchl4P58321 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uchl4P58321 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uchl4P58321 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uchl4P58321 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uchl4P58321 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uchl4P58321 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Uchl4P58321 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uchl4P58321 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uchl4P58321 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uchl4P58321 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uchl4P58321 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uchl4P58321 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uchl4P58321 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uchl4P58321 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uchl4P58321 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uchl4P58321 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uchl4P58321 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uchl4P58321 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uchl4P58321 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uchl4P58321 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uchl4P58321 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Uchl4P58321 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uchl4P58321 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uchl4P58321 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Uchl4P58321 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uchl4P58321 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uchl4P58321 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Uchl4P58321 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Uchl4P58321 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uchl4P58321 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uchl4P58321 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uchl4P58321 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uchl4P58321 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uchl4P58321 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uchl4P58321 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uchl4P58321 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uchl4P58321 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uchl4P58321 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uchl4P58321 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uchl4P58321 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uchl4P58321 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uchl4P58321 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Uchl4P58321 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uchl4P58321 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uchl4P58321 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uchl4P58321 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uchl4P58321 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uchl4P58321 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uchl4P58321 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uchl4P58321 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uchl4P58321 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uchl4P58321 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uchl4P58321 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uchl4P58321 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uchl4P58321 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uchl4P58321 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Uchl4P58321 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Uchl4P58321 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uchl4P58321 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uchl4P58321 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uchl4P58321 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uchl4P58321 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms