Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NcstnP57716 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NcstnP57716 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NcstnP57716 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NcstnP57716 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NcstnP57716 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NcstnP57716 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NcstnP57716 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NcstnP57716 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NcstnP57716 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NcstnP57716 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NcstnP57716 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NcstnP57716 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NcstnP57716 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NcstnP57716 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NcstnP57716 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NcstnP57716 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NcstnP57716 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NcstnP57716 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NcstnP57716 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NcstnP57716 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NcstnP57716 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NcstnP57716 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NcstnP57716 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NcstnP57716 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NcstnP57716 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NcstnP57716 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NcstnP57716 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NcstnP57716 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NcstnP57716 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NcstnP57716 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NcstnP57716 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NcstnP57716 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NcstnP57716 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NcstnP57716 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NcstnP57716 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NcstnP57716 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NcstnP57716 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NcstnP57716 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NcstnP57716 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NcstnP57716 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NcstnP57716 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NcstnP57716 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NcstnP57716 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NcstnP57716 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NcstnP57716 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NcstnP57716 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NcstnP57716 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NcstnP57716 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NcstnP57716 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NcstnP57716 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NcstnP57716 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NcstnP57716 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NcstnP57716 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NcstnP57716 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NcstnP57716 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NcstnP57716 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NcstnP57716 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NcstnP57716 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NcstnP57716 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NcstnP57716 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NcstnP57716 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NcstnP57716 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NcstnP57716 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NcstnP57716 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NcstnP57716 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NcstnP57716 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NcstnP57716 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NcstnP57716 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NcstnP57716 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NcstnP57716 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms