Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd38P56528 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd38P56528 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd38P56528 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd38P56528 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd38P56528 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd38P56528 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd38P56528 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd38P56528 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd38P56528 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd38P56528 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd38P56528 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd38P56528 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd38P56528 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd38P56528 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd38P56528 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd38P56528 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd38P56528 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd38P56528 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd38P56528 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd38P56528 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd38P56528 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd38P56528 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd38P56528 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd38P56528 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd38P56528 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd38P56528 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd38P56528 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd38P56528 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd38P56528 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd38P56528 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cd38P56528 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cd38P56528 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd38P56528 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd38P56528 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cd38P56528 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd38P56528 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd38P56528 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd38P56528 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd38P56528 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd38P56528 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd38P56528 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd38P56528 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd38P56528 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd38P56528 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd38P56528 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd38P56528 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd38P56528 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd38P56528 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd38P56528 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd38P56528 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd38P56528 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd38P56528 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd38P56528 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd38P56528 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd38P56528 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd38P56528 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd38P56528 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd38P56528 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd38P56528 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd38P56528 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd38P56528 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd38P56528 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd38P56528 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd38P56528 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd38P56528 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd38P56528 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd38P56528 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd38P56528 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd38P56528 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd38P56528 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd38P56528 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd38P56528 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cd38P56528 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd38P56528 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd38P56528 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd38P56528 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cd38P56528 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cd38P56528 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cd38P56528 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cd38P56528 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cd38P56528 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cd38P56528 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cd38P56528 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cd38P56528 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cd38P56528 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cd38P56528 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cd38P56528 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cd38P56528 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cd38P56528 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cd38P56528 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cd38P56528 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cd38P56528 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cd38P56528 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cd38P56528 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cd38P56528 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cd38P56528 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cd38P56528 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cd38P56528 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd38P56528 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms