Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Irf5P56477 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Irf5P56477 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Irf5P56477 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Irf5P56477 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Irf5P56477 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Irf5P56477 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Irf5P56477 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Irf5P56477 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Irf5P56477 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Irf5P56477 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Irf5P56477 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Irf5P56477 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Irf5P56477 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Irf5P56477 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Irf5P56477 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Irf5P56477 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Irf5P56477 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Irf5P56477 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Irf5P56477 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Irf5P56477 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Irf5P56477 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Irf5P56477 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Irf5P56477 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Irf5P56477 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Irf5P56477 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Irf5P56477 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Irf5P56477 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Irf5P56477 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Irf5P56477 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Irf5P56477 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Irf5P56477 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Irf5P56477 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Irf5P56477 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Irf5P56477 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Irf5P56477 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Irf5P56477 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Irf5P56477 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Irf5P56477 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Irf5P56477 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Irf5P56477 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Irf5P56477 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Irf5P56477 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Irf5P56477 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Irf5P56477 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Irf5P56477 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Irf5P56477 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Irf5P56477 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Irf5P56477 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Irf5P56477 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Irf5P56477 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Irf5P56477 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Irf5P56477 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Irf5P56477 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Irf5P56477 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Irf5P56477 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Irf5P56477 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Irf5P56477 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Irf5P56477 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Irf5P56477 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Irf5P56477 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Irf5P56477 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Irf5P56477 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Irf5P56477 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Irf5P56477 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Irf5P56477 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Irf5P56477 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Irf5P56477 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Irf5P56477 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Irf5P56477 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Irf5P56477 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Irf5P56477 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Irf5P56477 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Irf5P56477 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Irf5P56477 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Irf5P56477 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Irf5P56477 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Irf5P56477 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Irf5P56477 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Irf5P56477 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Irf5P56477 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Irf5P56477 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Irf5P56477 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Irf5P56477 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Irf5P56477 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Irf5P56477 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Irf5P56477 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Irf5P56477 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Irf5P56477 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Irf5P56477 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Irf5P56477 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Irf5P56477 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Irf5P56477 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Irf5P56477 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Irf5P56477 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Irf5P56477 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Irf5P56477 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Irf5P56477 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Irf5P56477 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Irf5P56477 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms