Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gp1bbP56400 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gp1bbP56400 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gp1bbP56400 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gp1bbP56400 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gp1bbP56400 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gp1bbP56400 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gp1bbP56400 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gp1bbP56400 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gp1bbP56400 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gp1bbP56400 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gp1bbP56400 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gp1bbP56400 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gp1bbP56400 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gp1bbP56400 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gp1bbP56400 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gp1bbP56400 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gp1bbP56400 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gp1bbP56400 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gp1bbP56400 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gp1bbP56400 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gp1bbP56400 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gp1bbP56400 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gp1bbP56400 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gp1bbP56400 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gp1bbP56400 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gp1bbP56400 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gp1bbP56400 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gp1bbP56400 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gp1bbP56400 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gp1bbP56400 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gp1bbP56400 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gp1bbP56400 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gp1bbP56400 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gp1bbP56400 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gp1bbP56400 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gp1bbP56400 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gp1bbP56400 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms