Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pex2P55098 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pex2P55098 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pex2P55098 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pex2P55098 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pex2P55098 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pex2P55098 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pex2P55098 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pex2P55098 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pex2P55098 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pex2P55098 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pex2P55098 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pex2P55098 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pex2P55098 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pex2P55098 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pex2P55098 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pex2P55098 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pex2P55098 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pex2P55098 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pex2P55098 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pex2P55098 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pex2P55098 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pex2P55098 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pex2P55098 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pex2P55098 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pex2P55098 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pex2P55098 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pex2P55098 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pex2P55098 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pex2P55098 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pex2P55098 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pex2P55098 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pex2P55098 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pex2P55098 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pex2P55098 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pex2P55098 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pex2P55098 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pex2P55098 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pex2P55098 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pex2P55098 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pex2P55098 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pex2P55098 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pex2P55098 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pex2P55098 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pex2P55098 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pex2P55098 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pex2P55098 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pex2P55098 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pex2P55098 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pex2P55098 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pex2P55098 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pex2P55098 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pex2P55098 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pex2P55098 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pex2P55098 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pex2P55098 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pex2P55098 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pex2P55098 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pex2P55098 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pex2P55098 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pex2P55098 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pex2P55098 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pex2P55098 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pex2P55098 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pex2P55098 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pex2P55098 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pex2P55098 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pex2P55098 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pex2P55098 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms