Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NrlP54846 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NrlP54846 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NrlP54846 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NrlP54846 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NrlP54846 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NrlP54846 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NrlP54846 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NrlP54846 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NrlP54846 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NrlP54846 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NrlP54846 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NrlP54846 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NrlP54846 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NrlP54846 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NrlP54846 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NrlP54846 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NrlP54846 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NrlP54846 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NrlP54846 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NrlP54846 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NrlP54846 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NrlP54846 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NrlP54846 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NrlP54846 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NrlP54846 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NrlP54846 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NrlP54846 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NrlP54846 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NrlP54846 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NrlP54846 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NrlP54846 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NrlP54846 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NrlP54846 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NrlP54846 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NrlP54846 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NrlP54846 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NrlP54846 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NrlP54846 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NrlP54846 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NrlP54846 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NrlP54846 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NrlP54846 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NrlP54846 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NrlP54846 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NrlP54846 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NrlP54846 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NrlP54846 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NrlP54846 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NrlP54846 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NrlP54846 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NrlP54846 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NrlP54846 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NrlP54846 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NrlP54846 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NrlP54846 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NrlP54846 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NrlP54846 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NrlP54846 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NrlP54846 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NrlP54846 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NrlP54846 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NrlP54846 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NrlP54846 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NrlP54846 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NrlP54846 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NrlP54846 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NrlP54846 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NrlP54846 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NrlP54846 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NrlP54846 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NrlP54846 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NrlP54846 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NrlP54846 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NrlP54846 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NrlP54846 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NrlP54846 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NrlP54846 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NrlP54846 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NrlP54846 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NrlP54846 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NrlP54846 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NrlP54846 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NrlP54846 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NrlP54846 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NrlP54846 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NrlP54846 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NrlP54846 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NrlP54846 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NrlP54846 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NrlP54846 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NrlP54846 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NrlP54846 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NrlP54846 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NrlP54846 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NrlP54846 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NrlP54846 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NrlP54846 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NrlP54846 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NrlP54846 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms