Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Faf1P54731 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Faf1P54731 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Faf1P54731 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Faf1P54731 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Faf1P54731 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Faf1P54731 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Faf1P54731 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Faf1P54731 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Faf1P54731 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Faf1P54731 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Faf1P54731 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Faf1P54731 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Faf1P54731 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Faf1P54731 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Faf1P54731 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Faf1P54731 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Faf1P54731 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Faf1P54731 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Faf1P54731 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Faf1P54731 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Faf1P54731 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Faf1P54731 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Faf1P54731 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Faf1P54731 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Faf1P54731 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Faf1P54731 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Faf1P54731 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Faf1P54731 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Faf1P54731 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Faf1P54731 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Faf1P54731 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Faf1P54731 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Faf1P54731 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Faf1P54731 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Faf1P54731 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Faf1P54731 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Faf1P54731 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Faf1P54731 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Faf1P54731 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Faf1P54731 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Faf1P54731 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Faf1P54731 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Faf1P54731 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Faf1P54731 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Faf1P54731 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Faf1P54731 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Faf1P54731 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Faf1P54731 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Faf1P54731 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Faf1P54731 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Faf1P54731 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Faf1P54731 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Faf1P54731 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Faf1P54731 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Faf1P54731 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Faf1P54731 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Faf1P54731 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Faf1P54731 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Faf1P54731 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Faf1P54731 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Faf1P54731 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Faf1P54731 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Faf1P54731 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Faf1P54731 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Faf1P54731 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Faf1P54731 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Faf1P54731 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Faf1P54731 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Faf1P54731 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Faf1P54731 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Faf1P54731 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms