Protein–RNA interactions for Protein: P53783

Sox1, Transcription factor SOX-1, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox1P53783 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox1P53783 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox1P53783 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sox1P53783 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sox1P53783 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sox1P53783 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sox1P53783 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sox1P53783 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sox1P53783 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox1P53783 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox1P53783 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox1P53783 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox1P53783 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sox1P53783 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sox1P53783 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox1P53783 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox1P53783 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sox1P53783 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox1P53783 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sox1P53783 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox1P53783 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox1P53783 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox1P53783 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox1P53783 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sox1P53783 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox1P53783 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox1P53783 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sox1P53783 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox1P53783 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox1P53783 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox1P53783 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox1P53783 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sox1P53783 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox1P53783 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox1P53783 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sox1P53783 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sox1P53783 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sox1P53783 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox1P53783 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox1P53783 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox1P53783 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox1P53783 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sox1P53783 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox1P53783 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox1P53783 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox1P53783 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sox1P53783 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox1P53783 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sox1P53783 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox1P53783 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox1P53783 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sox1P53783 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox1P53783 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox1P53783 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sox1P53783 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox1P53783 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sox1P53783 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox1P53783 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox1P53783 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox1P53783 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox1P53783 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sox1P53783 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox1P53783 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox1P53783 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox1P53783 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox1P53783 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sox1P53783 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox1P53783 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox1P53783 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sox1P53783 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox1P53783 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sox1P53783 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox1P53783 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox1P53783 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sox1P53783 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox1P53783 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox1P53783 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sox1P53783 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox1P53783 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox1P53783 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox1P53783 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sox1P53783 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sox1P53783 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sox1P53783 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sox1P53783 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sox1P53783 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox1P53783 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox1P53783 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox1P53783 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox1P53783 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sox1P53783 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sox1P53783 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox1P53783 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox1P53783 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox1P53783 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sox1P53783 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox1P53783 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox1P53783 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox1P53783 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sox1P53783 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 277.6 ms