Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Cux1P53564 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Cux1P53564 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Cux1P53564 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Cux1P53564 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Cux1P53564 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Cux1P53564 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Cux1P53564 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Cux1P53564 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Cux1P53564 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Cux1P53564 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Cux1P53564 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Cux1P53564 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Cux1P53564 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Cux1P53564 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Cux1P53564 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Cux1P53564 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Cux1P53564 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Cux1P53564 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Cux1P53564 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
Cux1P53564 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Cux1P53564 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Cux1P53564 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Cux1P53564 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Cux1P53564 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Cux1P53564 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Cux1P53564 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Cux1P53564 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Cux1P53564 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Cux1P53564 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Cux1P53564 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Cux1P53564 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Cux1P53564 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Cux1P53564 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Cux1P53564 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Cux1P53564 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Cux1P53564 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Cux1P53564 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Cux1P53564 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Cux1P53564 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Cux1P53564 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Cux1P53564 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Cux1P53564 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Cux1P53564 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Cux1P53564 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Cux1P53564 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Cux1P53564 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Cux1P53564 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Cux1P53564 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Cux1P53564 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Cux1P53564 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Cux1P53564 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Cux1P53564 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Cux1P53564 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Cux1P53564 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Cux1P53564 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Cux1P53564 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Cux1P53564 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Cux1P53564 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Cux1P53564 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Cux1P53564 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Cux1P53564 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Cux1P53564 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Cux1P53564 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cux1P53564 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Cux1P53564 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Cux1P53564 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cux1P53564 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cux1P53564 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Cux1P53564 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Cux1P53564 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Cux1P53564 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Cux1P53564 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Cux1P53564 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Cux1P53564 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Cux1P53564 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cux1P53564 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cux1P53564 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cux1P53564 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Cux1P53564 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Cux1P53564 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Cux1P53564 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cux1P53564 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cux1P53564 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cux1P53564 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Cux1P53564 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Cux1P53564 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Cux1P53564 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Cux1P53564 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cux1P53564 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cux1P53564 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cux1P53564 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cux1P53564 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cux1P53564 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cux1P53564 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cux1P53564 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Cux1P53564 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Cux1P53564 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Cux1P53564 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Cux1P53564 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms