Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClgnP52194 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ClgnP52194 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ClgnP52194 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClgnP52194 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClgnP52194 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClgnP52194 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClgnP52194 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ClgnP52194 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ClgnP52194 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ClgnP52194 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ClgnP52194 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ClgnP52194 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ClgnP52194 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ClgnP52194 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ClgnP52194 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ClgnP52194 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ClgnP52194 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ClgnP52194 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ClgnP52194 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ClgnP52194 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ClgnP52194 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ClgnP52194 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ClgnP52194 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ClgnP52194 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ClgnP52194 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ClgnP52194 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ClgnP52194 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ClgnP52194 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ClgnP52194 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ClgnP52194 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ClgnP52194 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ClgnP52194 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClgnP52194 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClgnP52194 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClgnP52194 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClgnP52194 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ClgnP52194 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ClgnP52194 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ClgnP52194 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ClgnP52194 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ClgnP52194 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ClgnP52194 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ClgnP52194 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ClgnP52194 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ClgnP52194 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ClgnP52194 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ClgnP52194 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ClgnP52194 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ClgnP52194 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ClgnP52194 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ClgnP52194 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ClgnP52194 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ClgnP52194 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ClgnP52194 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ClgnP52194 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ClgnP52194 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClgnP52194 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClgnP52194 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClgnP52194 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClgnP52194 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClgnP52194 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClgnP52194 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClgnP52194 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClgnP52194 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClgnP52194 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClgnP52194 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClgnP52194 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClgnP52194 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClgnP52194 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClgnP52194 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClgnP52194 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ClgnP52194 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClgnP52194 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClgnP52194 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClgnP52194 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClgnP52194 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClgnP52194 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ClgnP52194 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ClgnP52194 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ClgnP52194 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ClgnP52194 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ClgnP52194 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ClgnP52194 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ClgnP52194 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ClgnP52194 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ClgnP52194 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClgnP52194 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClgnP52194 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClgnP52194 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClgnP52194 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ClgnP52194 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClgnP52194 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.5 ms