Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc1a1P51906 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc1a1P51906 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc1a1P51906 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc1a1P51906 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc1a1P51906 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc1a1P51906 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc1a1P51906 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc1a1P51906 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc1a1P51906 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc1a1P51906 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc1a1P51906 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc1a1P51906 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc1a1P51906 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc1a1P51906 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc1a1P51906 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc1a1P51906 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc1a1P51906 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc1a1P51906 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc1a1P51906 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc1a1P51906 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc1a1P51906 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc1a1P51906 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc1a1P51906 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slc1a1P51906 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slc1a1P51906 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc1a1P51906 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc1a1P51906 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc1a1P51906 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc1a1P51906 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc1a1P51906 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc1a1P51906 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc1a1P51906 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc1a1P51906 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc1a1P51906 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc1a1P51906 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc1a1P51906 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc1a1P51906 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc1a1P51906 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc1a1P51906 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc1a1P51906 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc1a1P51906 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc1a1P51906 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc1a1P51906 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc1a1P51906 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc1a1P51906 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc1a1P51906 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc1a1P51906 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc1a1P51906 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc1a1P51906 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc1a1P51906 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc1a1P51906 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc1a1P51906 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc1a1P51906 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc1a1P51906 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc1a1P51906 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc1a1P51906 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc1a1P51906 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc1a1P51906 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc1a1P51906 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc1a1P51906 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc1a1P51906 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc1a1P51906 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc1a1P51906 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc1a1P51906 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc1a1P51906 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc1a1P51906 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slc1a1P51906 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Slc1a1P51906 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc1a1P51906 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc1a1P51906 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc1a1P51906 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc1a1P51906 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc1a1P51906 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc1a1P51906 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc1a1P51906 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc1a1P51906 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc1a1P51906 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc1a1P51906 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc1a1P51906 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc1a1P51906 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc1a1P51906 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc1a1P51906 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc1a1P51906 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc1a1P51906 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc1a1P51906 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc1a1P51906 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc1a1P51906 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc1a1P51906 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc1a1P51906 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc1a1P51906 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc1a1P51906 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc1a1P51906 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc1a1P51906 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc1a1P51906 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc1a1P51906 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc1a1P51906 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc1a1P51906 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc1a1P51906 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc1a1P51906 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms