Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CntfP51642 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CntfP51642 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CntfP51642 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CntfP51642 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CntfP51642 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CntfP51642 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CntfP51642 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CntfP51642 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CntfP51642 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CntfP51642 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CntfP51642 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CntfP51642 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CntfP51642 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CntfP51642 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CntfP51642 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CntfP51642 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CntfP51642 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CntfP51642 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CntfP51642 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CntfP51642 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CntfP51642 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CntfP51642 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CntfP51642 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CntfP51642 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CntfP51642 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CntfP51642 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CntfP51642 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CntfP51642 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CntfP51642 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CntfP51642 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CntfP51642 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CntfP51642 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CntfP51642 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CntfP51642 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CntfP51642 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CntfP51642 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CntfP51642 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CntfP51642 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CntfP51642 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CntfP51642 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CntfP51642 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CntfP51642 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CntfP51642 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CntfP51642 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CntfP51642 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CntfP51642 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CntfP51642 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CntfP51642 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CntfP51642 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CntfP51642 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CntfP51642 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CntfP51642 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CntfP51642 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CntfP51642 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CntfP51642 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CntfP51642 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CntfP51642 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CntfP51642 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CntfP51642 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CntfP51642 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CntfP51642 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CntfP51642 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CntfP51642 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CntfP51642 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CntfP51642 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CntfP51642 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CntfP51642 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CntfP51642 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CntfP51642 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CntfP51642 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CntfP51642 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CntfP51642 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CntfP51642 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CntfP51642 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CntfP51642 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CntfP51642 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CntfP51642 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CntfP51642 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CntfP51642 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CntfP51642 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CntfP51642 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CntfP51642 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CntfP51642 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CntfP51642 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CntfP51642 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CntfP51642 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CntfP51642 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CntfP51642 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CntfP51642 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CntfP51642 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CntfP51642 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CntfP51642 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CntfP51642 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CntfP51642 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CntfP51642 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CntfP51642 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CntfP51642 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CntfP51642 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CntfP51642 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms