Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FanccP50652 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FanccP50652 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FanccP50652 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FanccP50652 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FanccP50652 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FanccP50652 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FanccP50652 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FanccP50652 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FanccP50652 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FanccP50652 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FanccP50652 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FanccP50652 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FanccP50652 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
FanccP50652 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
FanccP50652 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FanccP50652 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FanccP50652 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FanccP50652 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FanccP50652 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FanccP50652 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FanccP50652 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FanccP50652 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FanccP50652 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FanccP50652 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FanccP50652 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FanccP50652 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FanccP50652 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FanccP50652 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FanccP50652 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FanccP50652 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FanccP50652 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FanccP50652 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FanccP50652 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FanccP50652 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FanccP50652 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FanccP50652 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FanccP50652 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FanccP50652 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FanccP50652 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FanccP50652 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FanccP50652 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FanccP50652 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FanccP50652 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FanccP50652 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FanccP50652 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FanccP50652 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FanccP50652 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FanccP50652 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FanccP50652 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FanccP50652 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FanccP50652 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FanccP50652 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FanccP50652 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FanccP50652 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FanccP50652 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FanccP50652 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FanccP50652 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FanccP50652 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FanccP50652 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FanccP50652 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FanccP50652 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FanccP50652 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FanccP50652 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FanccP50652 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FanccP50652 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FanccP50652 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FanccP50652 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FanccP50652 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FanccP50652 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FanccP50652 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FanccP50652 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FanccP50652 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FanccP50652 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FanccP50652 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FanccP50652 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FanccP50652 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FanccP50652 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FanccP50652 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FanccP50652 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FanccP50652 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FanccP50652 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FanccP50652 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FanccP50652 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FanccP50652 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FanccP50652 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FanccP50652 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FanccP50652 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FanccP50652 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FanccP50652 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FanccP50652 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FanccP50652 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FanccP50652 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FanccP50652 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FanccP50652 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FanccP50652 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FanccP50652 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FanccP50652 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FanccP50652 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FanccP50652 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms