Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FmodP50608 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FmodP50608 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FmodP50608 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FmodP50608 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FmodP50608 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FmodP50608 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FmodP50608 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FmodP50608 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FmodP50608 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FmodP50608 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FmodP50608 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FmodP50608 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FmodP50608 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FmodP50608 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FmodP50608 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FmodP50608 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FmodP50608 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FmodP50608 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FmodP50608 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FmodP50608 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FmodP50608 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FmodP50608 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FmodP50608 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FmodP50608 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FmodP50608 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FmodP50608 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FmodP50608 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FmodP50608 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FmodP50608 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FmodP50608 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FmodP50608 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FmodP50608 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FmodP50608 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FmodP50608 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FmodP50608 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FmodP50608 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FmodP50608 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FmodP50608 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FmodP50608 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FmodP50608 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FmodP50608 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FmodP50608 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FmodP50608 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FmodP50608 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FmodP50608 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FmodP50608 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FmodP50608 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FmodP50608 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FmodP50608 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FmodP50608 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FmodP50608 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FmodP50608 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FmodP50608 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FmodP50608 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FmodP50608 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FmodP50608 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FmodP50608 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FmodP50608 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FmodP50608 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FmodP50608 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FmodP50608 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FmodP50608 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FmodP50608 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FmodP50608 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FmodP50608 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FmodP50608 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FmodP50608 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FmodP50608 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FmodP50608 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FmodP50608 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FmodP50608 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FmodP50608 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FmodP50608 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FmodP50608 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FmodP50608 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FmodP50608 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FmodP50608 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FmodP50608 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FmodP50608 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FmodP50608 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FmodP50608 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FmodP50608 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FmodP50608 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FmodP50608 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FmodP50608 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FmodP50608 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FmodP50608 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FmodP50608 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FmodP50608 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FmodP50608 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FmodP50608 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FmodP50608 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FmodP50608 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FmodP50608 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FmodP50608 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FmodP50608 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FmodP50608 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FmodP50608 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FmodP50608 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms